Les décisions thérapeutiques sont prises en concertation, après discussion entre oncologues, gastro-entérologues, chirurgiens digestifs, radiothérapeutes, radiologues , médecin nucléaires et anatomopathologistes, selon les référentiels en cours lors de réunions de concertation pluri-disciplinaire (RCP) qui sont hebdomadaires.
Le traitement peut être médicamenteux (chimiothérapie, immunothérapie ou thérapie ciblée), chirurgical, ou peut faire appel à la radiothérapie. Il fait également appel au soins de support qui prend en charge les symptômes liés au cancer.